十几年前，被称为“门”的通道出现了，它连接异次元和这个世界，而进入到里面的人。被称之为“猎人”。猎人根据觉醒时的魔力量被分为等级，水筱旬被认为是最低的也是最弱的E级猎人。有一天，水筱旬参加迷宫的时候，在清扫完成迷宫后，在里面发现一个隐藏入口。

攻占低级迷宫的水篠旬，与同伴在迷宫深处发现了从未见过的神殿迷宫。在那里有着3个破解迷宫的规则以及超级恐怖令人绝望的怪物。由于神像怪物的攻击，同伴们一个接一个地丧命的情景，水篠旬感到束手无策的。在死亡与谜团的漩涡中，水篠旬发现的活路是——？

为了拯救幸存下来的为数不多的伙伴，水篠旬只身一人留在神殿迷宫。神像中的怪物挥舞着的剑，似乎想要杀死水篠旬。但等水篠旬回过神来，发现自己已经在医院的床上。在迷宫中失去的手脚也恢复了原来的样子，在这种情况下，出现了只有水篠旬才能看到的“窗口”。

水篠旬进入以地铁站为入口的迷宫后，一个接一个地打倒怪物并独自升级。然后，在一点点前进过程中，出现了一条通往地下深处的长长的楼梯。水篠旬向下到达腐朽生锈的站台，在那里等待的是一条需仰视可见的巨蛇。

为了攻占C级迷宫，水篠旬加入了右京隼人率领的猎人队伍，和他一起的还有首次进入迷宫的诸菱贤太。他们被要求不用战斗，水篠旬虽然对此感到疑问，但还是前往。在向地下迷宫的深处前进，一行人抵达了被玛瑙矿石包围的BOSS洞穴。

本以为是顺利攻占了C级迷宫，但由于踏入了BOSS睡觉的玛瑙矿石覆盖的空间，事态发生了变化。为了尽可能独占成为巨款的玛瑙矿石，右京隼人率领的猎人队伍成员背叛了旬和贤太，把两人关在了洞窟里。与BOSS的死斗的结果，旬被赋予了的新的“任务”。十几年前，被称为“门”的通道出现了，它连接异次元和这个世界，而进入到里面的人。被称之为“猎人”。猎人根据觉醒时的魔力量被分为等级，水筱旬被认为是最低的也是最弱的E级猎人。有一天，水筱旬参加迷宫的时候，在清扫完成迷宫后，在里面发现一个隐藏入口。

在攻略C级地下城时，旬一个也不剩地杀害了因欲望而对旬有杀意的右京攻击队。旬对自己毫不犹豫地夺走人命的自己感到困惑。尽管如此，旬依旧坚持完成每天的训练。一次完成训练后，出现了一个指引神秘地下城的钥匙。

为了卧病的母亲，旬需要得到挑战神秘地下城去获得“生命神水”。但是，以旬目前的水平，这一行为无异于自杀。就在这时，猎人协会发布了D级地下城的组团战。旬在前往地下城的时候，在那里遇到的人物是——？

接受猎人协会发布组团战的旬，与在卡特农神殿幸存下来的马渕、观月、真岛、羽村重逢。众人与猎人协会监视科的道门一起加入D级地下城的组团战。在地下城内的旬、马渕、观月，突然听到了真岛的悲鸣。来到时发现竟是是同伴们彻底改变的样子。

经过与道门的战斗，旬再一次杀害了人。犬饲忠告旬S级猎人右京已经将旬当作目标。为了提高水平，旬和贤太联手攻占C级地下城。而此时，大型公会的某个人物开始关注到一个接一个攻占迷宫的他们。

旬的窗口突然显示“转职任务”。旬预感到这会使他变得更强，于是踏上了转职任务入口的大门。面对不断袭来的怪物，旬虽然喘不过气，却足以迎战。在地下城的最深处，等待着他的，是能唤起卡特农神殿记忆的，拥有非凡力量的“骑士”。

虽然旬被逼得退无可退，但最终战胜了红色骑士“伊格利特”。还没来得及歇息，新的任务——转职任务已然出现。在无休止的战斗中，旬的力气消耗殆尽，竟然看到了过去自己的幻影。为了摆脱被称为“人类最弱兵器”的过去，以成为更强的自己为目标，旬努力寻找攻略转职任务的突破口。在攻略C级地下城时，旬一个也不剩地杀害了因欲望而对旬有杀意的右京攻击队。旬对自己毫不犹豫地夺走人命的自己感到困惑。尽管如此，旬依旧坚持完成每天的训练。一次完成训练后，出现了一个指引神秘地下城的钥匙。