千年王国研究所经常接到各种稀奇古怪的委托。研究所负责人埋木一郎又名“恶魔君”，这个天才少年是万年一见的奇才，却身世成谜。恶魔君将和搭档梅菲斯特三世一起破解一桩桩神秘案件，同时踏上寻根之旅，谱出一则另类的侦探搭档故事。