睁开眼的时候，切那已经丧失了记忆。那里是与世隔绝的岛屿·浦岛。就在切那对所有遇见的人都感到莫名其妙的时候，他的注意力被海边相遇的唱着歌的少女所吸引了。然后他不禁叫出了那个名字“凛音……？”。

凛音说出的令人震惊的话语。为了解开那个谜团，切那开始对“煤纹病”展开了调查。那个风土病使得整个岛屿固步自封，也对凛音、夏莲和纱罗她们的命运产生了巨大影响。然而他从凛音的母亲·玖音那里得知了意外的真相。

切那千方百计成功将凛音邀请出到了白天的海边。让短暂的快乐转瞬即逝的是，凛音看到秘密废屋的瞬间。在这之后，凛音在刻意地躲避自己的过去，然而夏莲却为了正视自己的过去而作出了某个重大的决断。

虽然是夏莲所期望的，切那准备干一件惊天动地的事。切那与夏莲逃出来后两人来到了本土，他们的目的地是夏莲母亲的所在处。就在切那在一旁默默守护的过程中，夏莲流下的眼泪到底意味着什么。而另一边，纱罗好像也被什么东西给压迫着似的。

心里在焦躁着“我已经没有时间了”的纱罗。面对知晓“切那穿越时空的秘密”、推测切那就是自己命运注定之人的她，凛音说出了黑暗的真相。为了结束染满鲜血的历史，红莲般的火焰点亮了夜晚的天空。

夏莲和纱罗终于走出了自己的黑暗。凛音在床边嘟囔着“所以这次要成为我的切那哦”。然后她迎来了自己与切那的幸福时光。下定了决心的凛音，决定要与过去告别然后迎接未来。然而玖音却露着一副意味深长的表情。

理应彻底忘掉了过去的两人。然而那段不祥的记忆却向凛音袭来。与此同时，切那也得知了全新的冲击性事实。事态突然转变，相信着“伴随着暴风雨，真实之门也会得以打开”的凛音独自一人，消失在了夜晚正狂风暴雨的海岸线上。

睁开双眼后，两人来到了和五年前一样的青空之下。那个凛音与真正的切那一起度过的，迎来了永远离别的梦幻之岛。就在凛音为能够与真正的切那再会以及能够结束这一切而高兴的时候，等待着她的是更加绝望的谜团、泪水以及黑暗。

在这个被冰块封闭了的称为“ISLAND”的地下避难所内的城市里，切那与一位名叫Rinne的少女相遇了，并为她那不可思议的发明提供帮忙。据说是能够拯救地球的发明，真假不明。然后，城市确确实实正在逐渐地消亡。

在这座看不到希望的城镇里，切那为了开拓未来而站了出来，然而等待着他的是接连而来的悲惨命运。过程中，Rinne完成了自己的发明，切那赌上人类存亡而向着未来出发了。在那之前，切那抱着Rinne，做了某个约定。

切那回过神来，发现自己正在和那个夏天同样的沙滩上。然后所有的一切都和那时候一样重复着。过程中，切那为了改变仅仅的那一件事，在那个瞬间展开了行动。然而等待着他的是冲击性的真相。

Rinne和凛音……围绕着两位少女的真相浮出了水面，切那作出了某个决断。那个决断能否让大家都露出笑容？在解开了巨大谜团后的前方，全新的未来正在等待着。再也不迷茫了。这是一个，永远的终曲。