某个雷雨之夜，英国贵族乔斯达爵士的马车意外翻覆。布朗度碰巧在现场，装做是爵士的救命恩人，卖他一个恩情。在那之後过了12年，布朗度过世，乔斯达家收容了他儿子的迪奥。乔斯达爵士的儿子乔纳森想跟同年纪的迪奥成为好朋友，却强烈地被拒绝。而且，乔纳森凡事都被拿来跟迪奥相比，让他觉得很沮丧。在那当中，他遇见了一位少女……

乔纳森与迪奥升上大学，迪奥正式成为乔斯达家的养子，而他想霸占乔斯达家的计划也持续在进行，他的目标是毒杀乔斯达爵士。另一方面，乔纳森偶然发现布朗度的信，开始怀疑父亲身体逐渐衰弱是因为中毒，为了查明真相，他决定前往伦敦。迪奥知道这件事之後，为了暗中守护他的祕密，决定利用乔纳森正在研究的神祕面具「石鬼面」。

乔纳森成功取得解药，回到乔斯达家大宅。乔纳森揭发迪奥的恶行，并质问他，迪奥态度良好地表示他有在反省。然而，出身黑暗街区的男人史比特瓦根很肯定地乔纳森说：「这小子是天生的坏胚子。」要他小心迪奥。迪奥被逼入绝境，自己带上了石鬼面，决定「超越人类」。于是，渴望鲜血而变得极为狂暴的迪奥，伸出魔爪袭击乔纳森……

与迪奥一战之後，身受重伤的乔纳森与艾莉娜重逢，艾莉娜寸步不离的照顾他，让他身心的伤势都日渐恢复。某一天，乔纳森前去查探发生惨剧的宅邸废墟，虽然没有找到石鬼面让他觉得很担心，但他还是想要遗忘那件事。然而，在回家的路上，他遇到了一名自称齐贝林的男人，使他的命运再度大幅转动。另一方面，一名坐着轮椅的男子，出现在让整个伦敦陷入恐惧的杀人魔「开膛手杰克」面前，那名男子竟是原应死在乔家大宅的迪奥……

「风之骑士镇」是一座被险峻断崖包围的小镇。乔纳森一行人来到了小镇的郊外，遇到了一个少年扒手波克，最後终於见到了迪奥本人。面对展现出残暴帝王的气势的迪奥，齐贝林与乔纳森不断使出波纹攻击，但波纹能量全都被迪奥用气化冷冻的方式封住了。迪奥更进一步地召唤出了作为尸生人复活过来的传说骑士塔尔卡斯与布拉霍德，发动猛烈的攻击。

乔纳森与布兰霍德的生死决斗继续，布兰霍德从两人的战斗中察觉到乔纳森勇者的资质，因而要求彼此尽最大的力量战斗。两人生死决斗的结果，布兰霍德藉由乔纳森的波纹取回了身为人类的痛觉与高洁的灵魂，他将「幸运与勇气之剑」交托给乔纳森之后即消灭。乔纳森等人对迪奥更加感到愤怒的同时，塔尔卡斯的剑正向他们发动攻击。他们一行人逃进古代骑士们用来作为修练场的遗迹之中，但是……

乔纳森被抓进了双头龙之厅，因为波可奋勇的行动，通往双头龙之厅的门打开了。齐贝林立刻前去解救乔纳森，但他脑中想到的却是以往他师父多配地告诉他的「死亡命运」！正如那命运所示，齐贝林的身体在塔尔卡斯的必杀技能攻击下，断成了两半。然而，他凭自己的意志使出了终极波纹「深仙脉疾走」，让濒死的乔纳森拥有崭新的力量。乔纳森因为波纹能量互相加乘的效果变得更强大，并展开充满愤怒与悲伤的反击……

脱离修练场之后，乔纳森一行人与齐贝林的师父多配地以及他的徒弟们会合，但镇民不断变成尸生人，让乔纳森感到相当焦急。另一方面，等着用尸生人压制他们的迪奥，正在引诱波可的姐姐成为自己的同伴，但他却受到无情的拒绝，于是他命令怪人杜比攻击她，但乔纳森出手拯救她脱离险境。乔纳森再度面对迪奥，他胸中怀抱着对许多人的思念，带着「幸运与勇气之剑」与迪奥决战！

迪奥与乔纳森之间的恩怨纠缠终于画下了句号。结束了这场生死决斗，乔纳森与为他献上一切、支持着他的心爱女人──艾莉娜结婚了。他们搭乘前往美国的蒸汽船前去渡蜜月，两人谈论着小时候的回忆，享受这幸福一刻。但那时候，乔纳森却看到了原本应该已被打倒的，迪奥的手下王钟……！在感到震惊的同时，乔纳森追着他来到了轮机室，结果却看到……

1938年，美国──。在已故祖父的知已好友史比特瓦根的邀请下，乔瑟夫・乔斯达与祖母艾莉娜一起从伦敦来到了纽约。乔瑟夫一抵达立刻被牵扯进一场纠纷当中，稍稍展露了他与生具来的波纹之力与尊贵血统的一鳞半角。另一方面，正在调查一座遗迹的史比特瓦根，遭到与他同行的史特雷所背叛……！史特雷告诉濒死的史比特瓦根，他对石鬼面与永生不死的渴望。

变成吸血鬼的史特雷出现在乔瑟夫面前的是！虽然乔瑟夫制敌机先的用机关枪扫射，但对方却完全没有受伤，这让乔瑟夫感到毛骨悚然。相对的，史特雷打算用必杀技一击斩杀乔瑟夫，却出乎意料地遭到乔瑟夫用机智的计策反击。「波纹法」的继承人史特雷已变成怪物，甚至用手榴弹炸成灰也他能复原，对面这样的敌人，乔瑟夫只剩下唯一的一个方法能对付他！而那精心准备的方法是……

为了调查史特雷所留下的信息「柱之男」的秘密，乔瑟夫一路前往墨西哥。在当地听到史比特华岗还存活的好消息，不由得感到非常高兴。另一方面，在囚禁史比特瓦根的地下实验室里，德军正在研究「柱之男」。他们在实验中，将石之男从石柱分离下来，将其命名为「桑塔纳」。在那之后，力量强大到能将石鬼面之男吸收掉的桑塔纳，开始更加快速地成长……

乔瑟夫终于来到墨西哥的地下研究所，见到了「柱之男桑塔纳」，彼此开始进入战斗。然而，乔瑟夫的波纹能量被桑塔纳的身体反弹出来，无法从外部攻击他。这时，乔瑟夫想到一个苦肉计，打算从桑塔纳的体内直接使用波纹。不过，桑塔纳的力量远远凌驾于吸血鬼之上，对他来说，乔瑟夫的波纹并不足以致命，他以令人惊异的速度开始恢复……

除了桑塔纳以外，也还有其在「柱之男」存在。乔瑟夫知道这件事情之后，遵照修特罗哈姆的遗言，与史比特瓦根一起飞往罗马。而在那里等待他的是威廉‧A‧齐贝林的孙子西撒。可能是感情直冲的乔瑟夫与爱装模作样的西撒八字不合，两人反目成仇。他们就在彼此厌恶的情况下，前去德军发现的「柱之男」所在之地。另一方面，地下遗迹「柱之男」正要从长眠中苏醒……

西撒的朋友被复活的「柱之男」──瓦姆乌、艾特西、卡兹三人所杀，他极为震怒。虽然他使出了有万全准备的必杀技「连环泡沫弹」，却被瓦姆乌用专门对付波纹的金属绳，轻易地击破了。他们「柱之男」在与二千年前就已存在的「波纹一族」的战斗中，早已学会了怎样对付波纹。西撒束手无策地站在一傍，相对地，乔斯达展露一手斩新的必杀技，挑战瓦姆乌等人。

乔瑟夫的心脏与喉咙被挂上了「毒戒指」，作为再战的誓约。他必须在33天之内战胜瓦姆乌与艾特西，否则就无法脱离戒指的诅咒束缚。然而，西撒知道以他们现在的实力打不赢瓦姆乌，他决定与乔瑟夫一起去造访住在威尼斯的波纹高手。那位高手是一位名叫莉莎莉莎的妙龄美女。乔瑟夫一开始看不起她的实力，最后亲身体验到她的强大，并借着一个月的严格修练，努力让自己更加成长！

莉莎莉莎给乔瑟夫一个最后的考验，那就是战胜罗吉兹师父。然而，当他来到试练场之后，等待他的不是罗吉兹而是「柱之男」艾西特。艾西特知道他们在找的「恩嘉红宝石」在莉莎莉莎手上，因而对他们发动了攻击。乔瑟夫对这预料之外的发展感到震惊，但为了阻止艾西特，他仍是展开了反击。乔瑟夫的波纹已经有长足进步，但那在艾西特面前能发挥功效吗……

乔瑟夫战胜艾西特之后，前去寻找莉莎莉莎准备向她报告这个情况。在那里，却看到女佣人苏丝Q正打算袭击莉莎莉莎。乔瑟夫知道原本应该已经被他打倒的艾西特附在苏丝Q身上，于是结合西撒的技能一起消灭艾西特。但艾西特已经将「恩嘉红宝石」送过去给同伴了。知道红宝石被送往瑞士的圣莫里茨之后，乔瑟夫等人，急忙追了过去！

原本应该在桑坦那之战中化为灰尘的德国军人修特罗哈姆，出现在「红宝石」送达的地点。已全身机械化的修特罗哈姆与现身想要谋夺「恩嘉红宝石」的卡兹开始战斗。两人展开了超越凡人的战斗，但使用「光之流法」的卡兹压制了修特罗哈姆。乔瑟夫看着他们展开生死决斗，并亲眼目赌卡兹掉落的「红宝石」在雪上滑向了悬崖，他为了拿回「红宝石」而开始在雪上狂冲……

西撒隐密的过去──，那也是发生在西撒父亲马利欧身上的悲剧故事。西撒想要洗刷谢比利一族长年累积的仇恨，为了打倒杀父仇人卡兹，他单独闯入了敌人的据点。在出现在那里的并不是卡兹，而是使用「风之流法」的瓦姆乌。肩负谢比利一族的荣耀，西撒开始与瓦姆乌交手。西撒与乔瑟夫一起经历了严刻的训练，他威力大增的波纹在瓦姆乌身上炸裂！

没有时间哀悼西撒的死亡，乔斯达与莉莎莉莎出发前往卡兹与瓦姆乌在等待的居室。那里除了卡兹他们以外，还有多达一百只的吸血鬼严阵以待。面对这压倒性强大的敌人数量，乔斯达显得极为焦躁，但莉莎莉莎赌上了「恩嘉红宝石」，对卡兹提议决斗。卡兹等人接受她的提议，并指定决斗的时间与地点。满月之夜，在名为「骸骨的脚跟石」的古代环状盘石场来一场不死不休的决斗……

「真正的格斗者」在环状盘石竞技场，祖士达对瓦姆乌的战车之战终于展开！乔斯达用各种小技俩超越了瓦姆乌，成功拿到第一回合的武器大铁锤。高兴没多久，卡兹口中号称「战斗天才」的瓦姆乌就用比乔斯达更高明的方法迎击。乔斯达在瓦姆乌出人意料的反击下，被挥下战车变得毫无防备。在这千钧一发的情况下，乔斯达采取了什么样的行动？

乔斯达与瓦姆乌的生死决斗，在双方一步不让的情况下，乔斯达逐渐占上风。在乔斯达聪明的计策下，受到致命一击的瓦姆乌，使出了最后的杀手锏──最终流法「浑楔飒」。然而，乔斯达反过来利用那攻击，从瓦姆乌手中获得了胜利。乔斯达达成了他对西撒的誓言，当场吞下了「毒戒指」的解药。接下来，剩下莉莎莉莎与卡兹的一战──。他们一行人前往下一个决斗场「毕兹贝路利那山神殿遗迹」。

卡兹以濒死的莉莎莉莎为诱饵，打算将乔斯达逼到身心具疲的绝境。然而比起被骗，乔斯达更擅长骗人，他用不断使出绝妙的奇策，以竭尽全力的波纹攻击，打倒了卡兹。这时，荣耀战士们的战斗，终于迎向了结尾。看着乔斯达拚命守护莉莎莉莎的强悍模样，史比特瓦根静静地说出他们的过往。那是跟莉莎莉莎与乔斯达有关的，一个悲伤离奇的命运的故事──

卡兹利用「恩嘉红宝石」中的石鬼面之力顺利复活，变成不怕太阳的「终极生命体」，这样的卡兹已是无敌的状态。乔斯达等人感觉到压倒性的实力差距，开始拚命逃亡，而在逃亡当中发现了德军的战斗机。乔斯达很快的坐进战斗机内之后，为了与纠缠不休的卡兹对抗，他而开始执行赌上性命的奇袭计划。面对不怕任何技能与武器、永生不死的终极生物，他有何种起死回生的计划呢……

卡兹在乔瑟夫的攻击下，落入岩浆之中。但即使如此，卡兹仍是再度复活了，乔瑟夫被砍下了手臂，发出绝望的呐喊。乔瑟夫抱着必死的决心，在卡兹对他发动致命一击的那一瞬间，他手上的「恩嘉红宝石」增强了波纹能量，武尔卡诺岛的火山开始喷发。强大到甚至喷出大气园外的岩浆将乔瑟夫与卡兹吞没……跨越好几世代的恩怨情仇，在此了结！