绫音是否能恢复意识？遭到侵略者攻击而负重伤的绫音，虽然因为A.E.G.I.S.网络及影山的努力而救回了一命，不过至今仍昏迷不醒。感到担心的美羽来到了影山公寓，并在聆听了影山的一番话後陷入了沉思。此时，幽灵少女突然出现在绫音身旁，并带走了她所收集的所有侵略者结晶，并在离开时留下了一句话：「这孩子跟我是一样的」。就在同时，都内侵略者的活动也突然跟著开始频繁了起来。幽灵少女利用夺来的结晶，在台场开启了一个巨大的负面闸门，此时出现的竟然是…？