旅行途中突降大雨，小智等人躲进了一栋无人居住的诡异宅邸，这里总是发生奇怪的事情，于是大伙决定另寻出口，没想到遇见了一个奇怪的生物。柚莉嘉莫名失踪，就在大伙寻找柚丽嘉时碰到了同样在这里躲雨的火箭队。这个生物是“自制神奇宝贝”妙喵，这栋宅子的原主人丽莎婆婆与妙喵成为了朋友，还把逝去丈夫送给她的项链交给了妙喵，然而等妙喵来归还项链的时候，老婆婆已经去世了……